Pues en mi empresa con los coches alquilados y asegurados en Mapfre ya nos ha pasado eso en mas de una ocasion, el IVA lo tiene que pagar el cliente, ahora no recuerdo la justificacion argumentada, creo que es porque la empresa de alquiler de coches es S.L. y no S.A. Eso si, te entregan una factura una vez realizas el pago.