Yo simplemente creo que depende del uso que le des al coche con la centralita, si vas sobrao a todos los sitios, apurando todas las marchas a 4000, si con el coche de serie tendrias problemas, con la centralita, aun mas, sobre todo porque el par aumenta considerablemente y elementos como tensores, correas y suerte el nuestro E90 la distribución es cadena, y diversos componentes mecanicos se verian perjudicados.
Ahora bien, si realmente utilizas el aumento de potencia y par, en las ocasiones que realmente lo necesites en el caso de la potencia, y en el par, pues simplemente para economizar en ciudad, oseasé, para ir a 1000rpm en tercera y que el coche responda sin problema, entonces mi opinión es que no perjudica nada, de nada.