Lo que permite el código de instalador es que no puedas usar un mando cualquiera solamente moviendo los "interruptores" a la misma posición.
Pero con un mando copión, que copia tanto esas posiciones como el código, no deberías tener problema (no soy un entendido en esto pero me ha tocado mirar todas las variantes porque tengo garajes de todos los tipos por desgracia).
Si fuese rolling code con código de instalador, es más jodienda porque guarda el número de pulsaciones y no puedes usar dos mandos con el mismo código, pero siendo código fijo puedes tener todos los mandos que quieras con el mismo código, que los leerá como que es el mismo mando.