Los alternadores llevan un pin marcado como D+ que es a la vez el de excitación y el del chivato de carga. Este terminal cuando esta parado o no genera es de tensión negativa o masa, como se quiera llamar, al generar pasa a positivo, el chivato por un lado va a este terminal y por el otro a positivo, por eso al cambiar de polaridad el terminal el chivato se apaga.
Las formas de excitarlo a sido siempre a través de la bombilla del chivato mandándole positivo al terminal, con la electrónica moderna ya no se usan bombillas lo cual llevo a meter resistencias y en otros casos a crear alternadores autoexcitables y lo único que tienen es un terminal que avisa de carga o no.
Si no se te apaga con el alternador nuevo pero si excitadolo manual, olvida esa zona y ve hacia el cuadro, en el cableado algo tienes mal que no hace esa función o incluso el propio cuadro puede estar mal, mírate el esquema correspondiente.
Suerte.